Российский химико-аналитический портал  химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов  
карта портала ::: расширенный поиск              
 


ANCHEM.RU » Форумы » Химические задачи ...
  Химические задачи | Список форумов | Войти в систему | Регистрация | Помощь | Последние темы | Поиск

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

АМИНОКИСЛОТЫ >>>

  Ответов в этой теме: 25
  Страница: 1 2 3
  «« назад || далее »»

[ Ответ на тему ]


Автор Тема: АМИНОКИСЛОТЫ
vikasssv
Пользователь
Ранг: 14

10.05.2021 // 12:57:37     
Редактировано 1 раз(а)

...
ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
vmu
Пользователь
Ранг: 1063


10.05.2021 // 14:03:39     
Сначала дайте определения понятий "нейтральная аминокислота" и "положительно заряженная аминокислота" и выясните, к каким из указанных аминокислот применимо правило Хюккеля.
vikasssv
Пользователь
Ранг: 14


10.05.2021 // 14:16:51     
Редактировано 1 раз(а)


vmu пишет:
Сначала дайте определения понятий "нейтральная аминокислота" и "положительно заряженная аминокислота" и выясните, к каким из указанных аминокислот применимо правило Хюккеля.
Нейтральные аминокислоты содержат гидроксильные (серин, треонин) или карбоксамидные группы (аспарагин, глутамин).
Основные (положительно заряженные аминокислоты) имеют положительный заряд при рН 7,0. (аргинин, гистидин, лизин)... Определение дала. Но теория Хюккеля же на доказательство ароматичности
vmu
Пользователь
Ранг: 1063


10.05.2021 // 14:42:50     
Редактировано 1 раз(а)

А "нейтральные" аминокислоты какой имеют заряд при pH 7.0? А "отрицательно заряженные"? Кто к ним относится?
Может это условное деление аминокислот привязано не точно к pH 7.0, а просто к наличию дополнительных кислотных или оснОвных групп в заместителе? Какие из аминокислот в вашем вопросе имеют ароматические группы? Какие электроны участвуют в образовании ароматических связей, а какие остаются свободными? У кого есть дополнительная оснОвная группа в заместителе? Про атомы азота в имидазальной и индольной группах гистидина и триптофана подумайте.
Еще табличка для размышлений:
www.chem.ucalgary.ca/courses/351/Carey5th/Ch27/ch27-1-4-2.html
vikasssv
Пользователь
Ранг: 14


10.05.2021 // 15:29:13     

vmu пишет:
А "нейтральные" аминокислоты какой имеют заряд при pH 7.0? А "отрицательно заряженные"? Кто к ним относится?
Может это условное деление аминокислот привязано не точно к pH 7.0, а просто к наличию дополнительных кислотных или оснОвных групп в заместителе? Какие из аминокислот в вашем вопросе имеют ароматические группы? Какие электроны участвуют в образовании ароматических связей, а какие остаются свободными? У кого есть дополнительная оснОвная группа в заместителе? Про атомы азота в имидазальной и индольной группах гистидина и триптофана подумайте.
Еще табличка для размышлений:
www.chem.ucalgary.ca/courses/351/Carey5th/Ch27/ch27-1-4-2.html

не понимаю(
Основные аминокислоты при рН 7,0 имеют положительный заряд за счет наличия в радикале аминогруппы (гистидин,лизин,арг), Кислые - отрицательный, за счет наличия в радикале карбоксильной группы (аспарагиновая и глутаминовая кислоты). Триптофан относится к неполярным АК, т.е.имеет незаряженный радикал

алифатические, содержащие карбоксамидную группу (аспарагин, глутамин), основные-гистидин, ароматический –триптофан

дополнительная основная группа в заместителе есть у аспаргина и глутамина

я не знаю, какие электроны участвуют в обр-и аром.связи(
про имидазальные и индольные группы первый раз слышу
а табличка зачем? я знаю про иэт белков
vmu
Пользователь
Ранг: 1063


10.05.2021 // 15:49:25     
Редактировано 2 раз(а)

У аминокислот, как видите, тоже есть ИЭТ (pI). Из таблицы можно понять, что при pH 7.0 суммарный положительный заряд имеют молекулы Lys, Arg, His. Молекулы всех остальных аминокислот имеют при этом pH суммарный отрицательный заряд. Поэтому обсуждаемая классификация аминокислот условно привязана лишь к кислотно-основным свойствам боковой группы:
"+": боковая группа имеет свойства основания (His, Lys, Arg).
"-": боковая группа имеет свойства кислоты (Asp, Glu).
"нейтральные": боковая группа не имеет ярко выраженных кислотно-основных свойств (все остальные аминокислоты).

Боковые группы Asn и Gln (содержат амидные группы -COONH2) не имеют кислотно-основных свойств, в отличие от Asp и Glu, где имеются кислотные группы -COOH.

Остается выяснить, почему боковая группа His имеет основные свойства, а Trp - нет. Обе аминокислоты содержат ароматические фрагменты, в образовании которых задействованы атомы азота (дают свои электроны на ароматическую связь). Какие-то из этих атомов азота не склонны к кислотно-основному взаимодействию (единственный атом азота в боковой группе Trp и один из атомов азота в боковой группе His). Но второй атом азота в боковой группе His чем-то отличается...

Что есть основание по Бренстеду-Лоури? А что есть кислота?
Каталог ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
Аврора-ИТ, ЗАО Аврора-ИТ, ЗАО
Компания Аврора-ИТ специализируется на внедрении информационных технологий класса LIMS (Лабораторных Информационных Систем) на предприятиях различных отраслей промышленности. Компания осуществляет полный комплекс услуг по внедрению ПО, включая сопровождение и техническую поддержку. Компания предлагает средство для автоматизации ВЛК согласно требованиям ГОСТ Р ИСО 5725 – программу «Lab5725X».
vmu
Пользователь
Ранг: 1063


10.05.2021 // 16:19:50     
Редактировано 1 раз(а)

Немного поясню про эту классификацию аминокислот. Смысл в том, что, когда аминокислота входит в состав белка, ее (главная) карбоксильная группа и альфа-аминогруппа идут на образование пептидной связи. Соответствующая группа атомов -СOONH- не имеет кислотно-основных свойств. Заряд аминокислотного остатка, входящего в состав белка, будет зависеть от кислотно-основных свойств боковой группы аминокислоты. При физиологических значениях pH (не слишком кислых, не слишком щелочных):
- остатки Asp и Glu имеют отрицательный заряд за счет диссоциации боковых карбоксильных групп (при сильно кислых pH они становятся нейтральными),
- остатки Lys и Arg имеют положительный заряд за счет протонирования их оснОвных групп (эти группы становятся незаряженными только при сильно щелочных pH),
- остаток His тоже будет иметь заряд от положительного до практически нулевого в зависимости от pH,
- остатки остальных аминокислот в белках при физиологически разумных значениях pH будут иметь нулевой заряд.

Т.е. в принципе можно сказать, что при pH 7.0 остатки Asp и Glu в составе белка несут отрицательный заряд, Arg, Lys, His - положительный (His - в общем положительный, но большинство его остатков будут нейтральны при этом pH), а остатки остальных АК не несут заряда (нейтральны).
vikasssv
Пользователь
Ранг: 14


10.05.2021 // 20:39:43     
Редактировано 1 раз(а)


vmu пишет:
У аминокислот, как видите, тоже есть ИЭТ (pI). Из таблицы можно понять, что при pH 7.0 суммарный положительный заряд имеют молекулы Lys, Arg, His. Молекулы всех остальных аминокислот имеют при этом pH суммарный отрицательный заряд. Поэтому обсуждаемая классификация аминокислот условно привязана лишь к кислотно-основным свойствам боковой группы:
"+": боковая группа имеет свойства основания (His, Lys, Arg).
"-": боковая группа имеет свойства кислоты (Asp, Glu).
"нейтральные": боковая группа не имеет ярко выраженных кислотно-основных свойств (все остальные аминокислоты).

Боковые группы Asn и Gln (содержат амидные группы -COONH2) не имеют кислотно-основных свойств, в отличие от Asp и Glu, где имеются кислотные группы -COOH.

Остается выяснить, почему боковая группа His имеет основные свойства, а Trp - нет. Обе аминокислоты содержат ароматические фрагменты, в образовании которых задействованы атомы азота (дают свои электроны на ароматическую связь). Какие-то из этих атомов азота не склонны к кислотно-основному взаимодействию (единственный атом азота в боковой группе Trp и один из атомов азота в боковой группе His). Но второй атом азота в боковой группе His чем-то отличается...

Что есть основание по Бренстеду-Лоури? А что есть кислота?

сложно...не могу вникнуть и до сих пор дать ответ на свой вопрос. я поняла, что заряд определяется боковыми группами
но нам же нужно дать док-во по двум теориям, а не определить заряд АК.. аа, помогитеее

кислоты отдают протоны, основания - принимают
vikasssv
Пользователь
Ранг: 14


10.05.2021 // 20:42:36     

vmu пишет:
Немного поясню про эту классификацию аминокислот. Смысл в том, что, когда аминокислота входит в состав белка, ее (главная) карбоксильная группа и альфа-аминогруппа идут на образование пептидной связи. Соответствующая группа атомов -СOONH- не имеет кислотно-основных свойств. Заряд аминокислотного остатка, входящего в состав белка, будет зависеть от кислотно-основных свойств боковой группы аминокислоты. При физиологических значениях pH (не слишком кислых, не слишком щелочных):
- остатки Asp и Glu имеют отрицательный заряд за счет диссоциации боковых карбоксильных групп (при сильно кислых pH они становятся нейтральными),
- остатки Lys и Arg имеют положительный заряд за счет протонирования их оснОвных групп (эти группы становятся незаряженными только при сильно щелочных pH),
- остаток His тоже будет иметь заряд от положительного до практически нулевого в зависимости от pH,
- остатки остальных аминокислот в белках при физиологически разумных значениях pH будут иметь нулевой заряд.

Т.е. в принципе можно сказать, что при pH 7.0 остатки Asp и Glu в составе белка несут отрицательный заряд, Arg, Lys, His - положительный (His - в общем положительный, но большинство его остатков будут нейтральны при этом pH), а остатки остальных АК не несут заряда (нейтральны).

мне кажется, вы рассматриваете слишком глубоко. у меня этот вопрос будет на экзамене, я думаю, пойдет и поверхностный ответ, так сказать. я, наверное, не понимаю химию на том уровне, на котором находитесь вы
vmu
Пользователь
Ранг: 1063


10.05.2021 // 21:49:07     
Редактировано 2 раз(а)

Правильно, кислоты отдают протоны (являются донорами протонов), основания принимают протоны (являются акцепторами протонов). Asn, Gln, Trp относятся к нейтральным АК, т.к. их боковые группы не имеют кислотно-основных свойств. В амидной группе нет донора протона (от азота протоны нелегко оторвать). Акцептором протона амидная группа также не является, т.к. неподеленная электронная пара атома азота, к которой мог бы присоединиться протон (как это происходит с аммиаком или аминами), оттягивается группой атомов C=O.

His и Trp содержат имидазольный и индольный фрагменты соответственно, которые являются ароматическими и удовлетворяют правилу Хюккеля. В имидазоле 6 электронов (6 = 4*1 + 2) ароматической системы - это по одному электрону от каждого из трех атомов углерода, один электрон от азота, который не связан с атомом водорода, и два электрона от атома азота, который NH. В индоле единственный азот также отдает целую электронную пару в ароматическую систему.

Азот имеет пять электронов на внешней электронной оболочке. Азот, который NH, три электрона расходует на ковалентные сигма-связи с атомами углерода и водорода, а еще 2 оставшихся электрона уходят на ароматическую пи-связь. Итого, у этого атома азота не остается свободной электронной пары (как в индольном фрагменте Trp, так и в имидазольном фрагменте His), поэтому этот атом азота не проявляет основных свойств (а отдавать протон он тоже не любит). А вот второй атом азота в имидазоле (His) дает 2 электрона на сигма-связи с атомами углерода и 1 электрон в ароматическую пи-связь. Еще пара электронов у этого азота остается свободной (как в аммиаке и в аминах), и за счет нее он способен присоединить протон. За счет этого атома азота, имеющего свободную пару электронов, не вовлеченную в ароматическую систему, боковая группа His имеет (слабые) основные свойства, а аминокислоту можно отнести к "положительно заряженным".

Почитайте дополнительно про ароматичность, строение (и их влияние на кислотно-основные свойства) ароматических геретоциклов* (пиридина, пиррола, имидазола, индола).

* гетероциклов.
vikasssv
Пользователь
Ранг: 14


10.05.2021 // 22:38:33     

vmu пишет:
Правильно, кислоты отдают протоны (являются донорами протонов), основания принимают протоны (являются акцепторами протонов). Asn, Gln, Trp относятся к нейтральным АК, т.к. их боковые группы не имеют кислотно-основных свойств. В амидной группе нет донора протона (от азота протоны нелегко оторвать). Акцептором протона амидная группа также не является, т.к. неподеленная электронная пара атома азота, к которой мог бы присоединиться протон (как это происходит с аммиаком или аминами), оттягивается группой атомов C=O.

His и Trp содержат имидазольный и индольный фрагменты соответственно, которые являются ароматическими и удовлетворяют правилу Хюккеля. В имидазоле 6 электронов (6 = 4*1 + 2) ароматической системы - это по одному электрону от каждого из трех атомов углерода, один электрон от азота, который не связан с атомом водорода, и два электрона от атома азота, который NH. В индоле единственный азот также отдает целую электронную пару в ароматическую систему.

Азот имеет пять электронов на внешней электронной оболочке. Азот, который NH, три электрона расходует на ковалентные сигма-связи с атомами углерода и водорода, а еще 2 оставшихся электрона уходят на ароматическую пи-связь. Итого, у этого атома азота не остается свободной электронной пары (как в индольном фрагменте Trp, так и в имидазольном фрагменте His), поэтому этот атом азота не проявляет основных свойств (а отдавать протон он тоже не любит). А вот второй атом азота в имидазоле (His) дает 2 электрона на сигма-связи с атомами углерода и 1 электрон в ароматическую пи-связь. Еще пара электронов у этого азота остается свободной (как в аммиаке и в аминах), и за счет нее он способен присоединить протон. За счет этого атома азота, имеющего свободную пару электронов, не вовлеченную в ароматическую систему, боковая группа His имеет (слабые) основные свойства, а аминокислоту можно отнести к "положительно заряженным".

Почитайте дополнительно про ароматичность, строение (и их влияние на кислотно-основные свойства) ароматических геретоциклов (пиридина, пиррола, имидазола, индола).


хорошо, разберусь с этим, спасибо!
хотя этот последний комментарий полностью можно писать как ответ на вопрос)

  Ответов в этой теме: 25
  Страница: 1 2 3
  «« назад || далее »»

Ответ на тему


ААС, ИСП-АЭС, ИСП-МС - прямые поставки в 2022 году

ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU:      [ Все новости ]


ЖУРНАЛ ЛАБОРАТОРИИ ЛИТЕРАТУРА ОБОРУДОВАНИЕ РАБОТА КАЛЕНДАРЬ ФОРУМ

Copyright © 2002-2022
«Аналитика-Мир профессионалов»

Размещение рекламы / Контакты