Российский химико-аналитический портал  химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов  
карта портала ::: расширенный поиск              
 


ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ...
  1. Аналитический форум | Список форумов | Войти в систему | Регистрация | Помощь | Последние темы | Поиск

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

cis-/trans- положения двойной связи в ЖК >>>

  Ответов в этой теме: 29
  Страница: 1 2 3
  «« назад || далее »»

[ Ответ на тему ]


Witaliy
Пользователь
Ранг: 171


04.02.2012 // 22:00:34     
А для того чтобы определить времена удерживания для транс-изомеров метиловых эфиров кислот C18:1 C18:2 возьмите какой-нибудь маргарин, выделите жир (например хотя бы высушив при 105С), проведите простенькую переэтерификацию с метанольным раствором гидроксида калия.
P.S. Желательно записать ИК спектр выделенного жира из маргарина на Вашем 75IR (чтобы убедиться в наличии большого количества транс-изомеров, а то может у Вас перестали экономить при производстве ). Спектр этого жира можно записывать и в тонком слое на кристалле NaCl. Должна быть интенсивная полоса в интервале частот 960-970 см-1.
ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1302


07.02.2012 // 1:23:45     
Редактировано 1 раз(а)

Похоже, задача не имеет решения. Проще сделать вид, что этих "изомеров" не было ;D
virtu
VIP Member
Ранг: 2134


07.02.2012 // 11:51:15     
Редактировано 2 раз(а)


Chamomillablue пишет:
Похоже, задача не имеет решения. Проще сделать вид, что этих "изомеров" не было ;D
Как это не имеет? Совершать ошибки тоже проще. Так работать нельзя.

1. Данные посмотрел. По масс-спектрам, как, в общем, уже не однократно писалось выше, идентифицировать цис/транс (или что-то другое) нельзя. Да, различия в мелочах есть (в рамках одного эксперимента), но этого недостаточно, тем более надо статистику набирать, а не по одной хроматограмме...

2. Далее, думаю кривая дериватизация (DMOX) - слишком грязно (побочные реакции, деструкция дериватов), нитрилы всякие. В общем, Ваша задача не идентифицировать цис/транс, а найти ошибки, точнее, понять и доказать какой из двух результатов кривой.

3. Не забывайте об "эффекте матрицы". Т.е. проблема может быть в пробоподготовке на этапе экстракции и очистки, т.к. термически индуцированная изомеризация отпадает (если это действительно цис/транс, очень похоже, но...).

З.Ы.: lipidlibrary.aocs.org/ms/ms02/index.htm "Unfortunately, we have often observed incomplete reaction and appearance of an intermediate that elutes later from GC columns (and gives a mass spectrum almost identical to that of the required derivative). It is important to keep the product and reaction mixtures as dry as possible, otherwise traces of moisture can cause ring opening, even on storage in inert solvents at low temperatures [1]. For the same reason, it is not possible to purify DMOX derivatives by adsorption chromatography."
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1302


07.02.2012 // 13:18:54     
Редактировано 3 раз(а)


virtu пишет:

Chamomillablue пишет:
Похоже, задача не имеет решения. Проще сделать вид, что этих "изомеров" не было ;D
Как это не имеет? Совершать ошибки тоже проще. Так работать нельзя.

1. Данные посмотрел. По масс-спектрам, как, в общем, уже не однократно писалось выше, идентифицировать цис/транс (или что-то другое) нельзя. Да, различия в мелочах есть (в рамках одного эксперимента), но этого недостаточно, тем более надо статистику набирать, а не по одной хроматограмме...

2. Далее, думаю кривая дериватизация (DMOX) - слишком грязно (побочные реакции, деструкция дериватов), нитрилы всякие. В общем, Ваша задача не идентифицировать цис/транс, а найти ошибки, точнее, понять и доказать какой из двух результатов кривой.

3. Не забывайте об "эффекте матрицы". Т.е. проблема может быть в пробоподготовке на этапе экстракции и очистки, т.к. термически индуцированная изомеризация отпадает (если это действительно цис/транс, очень похоже, но...).

З.Ы.: lipidlibrary.aocs.org/ms/ms02/index.htm "Unfortunately, we have often observed incomplete reaction and appearance of an intermediate that elutes later from GC columns (and gives a mass spectrum almost identical to that of the required derivative). It is important to keep the product and reaction mixtures as dry as possible, otherwise traces of moisture can cause ring opening, even on storage in inert solvents at low temperatures [1]. For the same reason, it is not possible to purify DMOX derivatives by adsorption chromatography."

Не так уж и грязно - всей "грязи" не более 10%. При том, что максимально возможный выход хлорангидридов 95%, т.е. остаются СЖК и т.д. От чего зависит образование нитрилов мне до сих пор никто не сказал, сколько бы не спрашивал. А без этого трудно исключать возможные ошибки в методике синтеза...
Плюс, от 1 до 10% при замыкании цикла всегда образуются 5'5'-DMOX, которые обладают идентичным спектром и близким временем удерживания. Но в исходной хроматограмме пиков во-первых явно больше - для линоленовой кислоты, и их площади явно выше обозначенных порогов для побочных продуктов.
Меня, например, сильно смущает пункт методики, в котором к сухим DMOXам капают воду и гексан и собирают гексановую фракцию. Понятно, что это для очистки, но вода всё-таки..
Эксперимент, ясень пень, надо повторить... Но пока теперь вырастет образец ))
Witaliy
Пользователь
Ранг: 171


07.02.2012 // 22:38:11     
Посмотрел Вашу хроматограмму. Правда только мельком - завал на работе.
Пики "транс-изомеров" очень большие.
Я не биолог, но по-моему в природных объектах транс-изомеры практически не встречаются. Исправьте, если не так.
Да и как написал выше - DB-23 делит цис/транс изомеры метиловых эфиров жирных кислот. Так что похоже в Вашем случае нет транс-изомеров: "Из одной части сделал FAMEs, из другой - DMOX. В FAMEs все впорядке - один пик олеиновой - большой, линолевой и линоленовой кислот."
Каталог ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
Экспресс-анализатор водорода МЕТАВАК-В Экспресс-анализатор водорода МЕТАВАК-В
Экспресс анализатор для определения водорода в металлах и сплавах. Принцип действия прибора основан на методе восстановительного плавления в потоке газа-носителя. Детектором для водорода является ячейка теплопроводности.
[ Информация из каталога оборудования ANCHEM.RU ]
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1302


08.02.2012 // 1:03:15     

Witaliy пишет:
Посмотрел Вашу хроматограмму. Правда только мельком - завал на работе.
Пики "транс-изомеров" очень большие.
Я не биолог, но по-моему в природных объектах транс-изомеры практически не встречаются. Исправьте, если не так.
Да и как написал выше - DB-23 делит цис/транс изомеры метиловых эфиров жирных кислот. Так что похоже в Вашем случае нет транс-изомеров: "Из одной части сделал FAMEs, из другой - DMOX. В FAMEs все впорядке - один пик олеиновой - большой, линолевой и линоленовой кислот."


Угу, ЖК с трансконформациями метаболически не активны, ибо нет таких ферментов с сайтом связывания транс-кислот..А в биохимии все строго комплементарно
Я, увы, как раз биолог, вынужденный решать такие вот химические задачи
Ладно, будем повторять эксперимент и анализы. В след раз еще и пиколиниловые сварю, хоть DB-23 их и не любит...
virtu
VIP Member
Ранг: 2134


08.02.2012 // 3:53:11     
Редактировано 2 раз(а)

1. TC: "Принесли мне недавно свободные жирные кислоты, "сваренные" из одного растительного объекта, который ростили в нечеловеских условиях."

2. lipidlibrary.aocs.org/plantbio/unusualfa/index.htm (etc.)

3. Нет информации о растительном объекте (например, были ли генетические модификации/генетическая инженерия и т.д.).

4. Нет информации о "нечеловеских условиях" и т.д.

5. В бактериальном мире все интереснее: jb.asm.org/content/185/5/1730.full (и т.д. и т.п.), т.е. к вопросу о бактериальной контаминации сэмпла.

6. Нет информации о надежности идентификации МЭЖК.

7. Да, высоковероятено, что в случе с DMOX - "кривые" результаты.

8. Другими словами, заниматься экстраполяцией (только цис-изомеры), в данной ситуации (с учетом инфы в этой ветке), нерационально и может привести к заблуждению.
Chamomillablue
Пользователь
Ранг: 1302


08.02.2012 // 12:55:31     
Редактировано 1 раз(а)


virtu пишет:
1. TC: "Принесли мне недавно свободные жирные кислоты, "сваренные" из одного растительного объекта, который ростили в нечеловеских условиях."

2. lipidlibrary.aocs.org/plantbio/unusualfa/index.htm (etc.)

3. Нет информации о растительном объекте (например, были ли генетические модификации/генетическая инженерия и т.д.).

4. Нет информации о "нечеловеских условиях" и т.д.

5. В бактериальном мире все интереснее: jb.asm.org/content/185/5/1730.full (и т.д. и т.п.), т.е. к вопросу о бактериальной контаминации сэмпла.

6. Нет информации о надежности идентификации МЭЖК.

7. Да, высоковероятено, что в случе с DMOX - "кривые" результаты.

8. Другими словами, заниматься экстраполяцией (только цис-изомеры), в данной ситуации (с учетом инфы в этой ветке), нерационально и может привести к заблуждению.

1. Объект Mesembrianthemum cristallinum L - растение из группы галофитов, способное менять путь фотосинтеза с С3 на С4 и обратно в зависимости от условий среды. В эксперименте использовали Дикий Тип. Объект выращивали в условиях сильного засоления и действия тяжелых металлов.
2. Бактериальная примесь слишком недостоверная гипотеза. Чтобы получить хотя бы 1 мг СЖК из бактерий, нужен грамм отмытых от питательной среды микроорганизмов, а это не менее 1 литра культуральной суспензии. Если их примесь и есть, то она совершенно незначительна и никакого влияния на ЖК-состав пробы не влияет.
3. FAMEs идентифицируются по нескольким признакам: помимо NISTа, обращается внимание на RT, RRT и ECL.
4. Про необычные ЖК и специфичные для их метаболизма ферментные системы читано не только по этой ссылке, но и в книге Ванса и Ванса, в главе, написанной Дж. Олроджем и К. Смит (Elsevier, 2009).
5. Я не утверждаю что там только цис-, вполне допускаю транс-, но с тз классической биохимии это все-таки нонсенс, хотя есть и исключения.
OldBrave
VIP Member
Ранг: 1314


11.02.2012 // 2:01:48     
Редактировано 1 раз(а)


Chamomillablue пишет:
Похоже, задача не имеет решения. Проще сделать вид, что этих "изомеров" не было ;D
Возможно, при значительном количестве материала, метиловые эфиры прогнать ВЭЖХ/ELSD на Ag-колонке.

  Ответов в этой теме: 29
  Страница: 1 2 3
  «« назад || далее »»

Ответ на тему


ААС, ИСП-АЭС, ИСП-МС - прямые поставки в 2022 году

ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU:      [ Все новости ]


ЖУРНАЛ ЛАБОРАТОРИИ ЛИТЕРАТУРА ОБОРУДОВАНИЕ РАБОТА КАЛЕНДАРЬ ФОРУМ

Copyright © 2002-2022
«Аналитика-Мир профессионалов»

Размещение рекламы / Контакты