Российский химико-аналитический портал  химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов  
карта портала ::: расширенный поиск              
 


ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ...
  1. Аналитический форум | Список форумов | Войти в систему | Регистрация | Помощь | Последние темы | Поиск

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

Определение маркеров аллергии? >>>

  Ответов в этой теме: 25
  Страница: 1 2 3
  «« назад || далее »»

[ Ответ на тему ]


Spectrometrist
Пользователь
Ранг: 777


08.10.2014 // 12:47:14     

ATem пишет:
Ибо даже при работе с малыми молекулами в плазме сталкиваюсь с такими чудесными чудесами, что при мысли о том, что там будет на тяжелых массах становится немного не по себе Это уже задачка для гуру, а не для начинающих


ИМХО, не очевидно, я бы не стал так бояться белков

Представьте у вас есть какая то разумно-сложная (скажем, 10-100 белков) фракция с аллергенной активностью. Идентифицировать ее состав задачка для практикума по протеомиксу, рутинное дело - для животных белков которые или все (или их близкие гомологи) в датабазе, и нужно вам для этотого пикомоли материала, а реально сильно меньше. Про каждый белок уже реально много известно (knowledge databases), уверен в том числе и про аллергенные свойства если таковые замечались и все это в public domain. Мы как то давно работали с пчелиным ядом, отсюда мои догадки.

С маленькими же молекулами (ИМХО) можно огресть счастья по полной: все они индивидуальны по свойствам, в масс спеке / хроматографии ведут себя по разному, на ЯМР нужны милиграммы и т.д.

Удача только если на GC-MS или LC-MS/MS подцепите библиотечным поиском и, к тому же, будет уже известно что это потенциальный аллерген. По разговорам с коллегами, если на GC-MS слепой (т.е. без гипотез и через полную датабазу) поиск как то работает, то метаболиты на LC-MS/MS это еще та радость: слишком велико влияние дизайна масс спектрометра, энергии активации (collision energy) и плотности газа в ячейке (collision cell), которая часто толком и не контролируется.
ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246
Andrew
VIP Member
Ранг: 1370


08.10.2014 // 14:04:14     
Спасибо за приглашение. Зайду обязательно.
ATem
Пользователь
Ранг: 655


08.10.2014 // 18:41:25     
Уважаемый Spectrometrist, не могу, к сожалению, объективно ответить, поскольку для меня протеомика всегда была (и есть) чем-то нереальным и дико сложным...
С малыми молекулами (по-крайней мере, с моими образцами) я хотя бы примерно представляю, кого искать и могу делать это на ВЭЖХ-МС/МС и ГХ-МС (в идеале - ГХ-МС/МС). Но, Ваша правда, без ГХ-МС почти нереально. Хотя дело, наверное, не только в том, что библиотеки спасают, для новых веществ они не особо актуальны, но еще и в том, что на ГХ у меня все массы выше 45 Да рабочие, нет особо шума и есть EI...
Хотя... Многое зависит от того, с чем и как привык работать, наверное
kump
Пользователь
Ранг: 3197


08.10.2014 // 18:59:02     
Не вполне понятно зачем всё это.
Ведь когда у Вас определяют группу крови, то обходятся без МС - капнули на пластинку и всё: свернулось-не свернулось. Примерно также можно наверняка поступать и с пищевыми продуктами.
Чего хотят-то.
ATem
Пользователь
Ранг: 655


08.10.2014 // 19:07:33     
Редактировано 1 раз(а)

Уважаемый коллега kump!
Конечно ж можно... Есть же ИФА, который может в этом здорово помочь, насколько я понимаю... Ну, когда переговорю с ними, попробую еще выбить информации

  Ответов в этой теме: 25
  Страница: 1 2 3
  «« назад || далее »»

Ответ на тему


ААС, ИСП-АЭС, ИСП-МС - прямые поставки в 2022 году

ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU:      [ Все новости ]


ЖУРНАЛ ЛАБОРАТОРИИ ЛИТЕРАТУРА ОБОРУДОВАНИЕ РАБОТА КАЛЕНДАРЬ ФОРУМ

Copyright © 2002-2022
«Аналитика-Мир профессионалов»

Размещение рекламы / Контакты