| Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
 |
|
| ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
 |
Определение маркеров аллергии? >>>
|
 |
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
 08.10.2014 // 12:47:14
ИМХО, не очевидно, я бы не стал так бояться белков Представьте у вас есть какая то разумно-сложная (скажем, 10-100 белков) фракция с аллергенной активностью. Идентифицировать ее состав задачка для практикума по протеомиксу, рутинное дело - для животных белков которые или все (или их близкие гомологи) в датабазе, и нужно вам для этотого пикомоли материала, а реально сильно меньше. Про каждый белок уже реально много известно (knowledge databases), уверен в том числе и про аллергенные свойства если таковые замечались и все это в public domain. Мы как то давно работали с пчелиным ядом, отсюда мои догадки. С маленькими же молекулами (ИМХО) можно огресть счастья по полной: все они индивидуальны по свойствам, в масс спеке / хроматографии ведут себя по разному, на ЯМР нужны милиграммы и т.д. Удача только если на GC-MS или LC-MS/MS подцепите библиотечным поиском и, к тому же, будет уже известно что это потенциальный аллерген. По разговорам с коллегами, если на GC-MS слепой (т.е. без гипотез и через полную датабазу) поиск как то работает, то метаболиты на LC-MS/MS это еще та радость: слишком велико влияние дизайна масс спектрометра, энергии активации (collision energy) и плотности газа в ячейке (collision cell), которая часто толком и не контролируется. |
|
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
|
Andrew VIP Member Ранг: 1370 |
08.10.2014 // 14:04:14
Спасибо за приглашение. Зайду обязательно. |
|
ATem Пользователь Ранг: 655 |
08.10.2014 // 18:41:25
Уважаемый Spectrometrist, не могу, к сожалению, объективно ответить, поскольку для меня протеомика всегда была (и есть) чем-то нереальным и дико сложным...  С малыми молекулами (по-крайней мере, с моими образцами) я хотя бы примерно представляю, кого искать и могу делать это на ВЭЖХ-МС/МС и ГХ-МС (в идеале - ГХ-МС/МС). Но, Ваша правда, без ГХ-МС почти нереально. Хотя дело, наверное, не только в том, что библиотеки спасают, для новых веществ они не особо актуальны, но еще и в том, что на ГХ у меня все массы выше 45 Да рабочие, нет особо шума и есть EI... Хотя... Многое зависит от того, с чем и как привык работать, наверное |
|
kump Пользователь Ранг: 3126 |
08.10.2014 // 18:59:02
Не вполне понятно зачем всё это. Ведь когда у Вас определяют группу крови, то обходятся без МС - капнули на пластинку и всё: свернулось-не свернулось. Примерно также можно наверняка поступать и с пищевыми продуктами. Чего хотят-то. |
|
ATem Пользователь Ранг: 655 |
08.10.2014 // 19:07:33
Редактировано 1 раз(а) Уважаемый коллега kump! Конечно ж можно... Есть же ИФА, который может в этом здорово помочь, насколько я понимаю... Ну, когда переговорю с ними, попробую еще выбить информации
|
| |
||
|
Ответов в этой теме: 25
|
||
| ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
| Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
|
Размещение рекламы / Контакты |
[]
