Форумы ANCHEM.RU: Выбор масс-спектрометра - протеомика, биомаркеры.

Российский химико-аналитический портал

химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов

карта портала ::: расширенный поиск

ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ...

Форум химиков-аналитиков, аналитическая химия и химический анализ.

Выбор масс-спектрометра - протеомика, биомаркеры. >>>

  Ответов в этой теме: 20
  Страница: 1 2
  «« назад || далее »»

[ Ответ на тему ]

forum_reader
Пользователь
Ранг: 17

10.08.2011 // 23:08:06

Gl пишет:
Вот, и какую выбирать ионизацию и тип прибора для этого? Выбирать между ESI-QTOF и MALDI-TOF/TOF? Или еще добавить ESI-Orbitrap и 3Q?

Если сразу закладываться на количественное определение, как обязательную опцию протеомной машины, то надо брать ESI-QTOF. Тоже с ПТМ...

У MALDI в противовес есть MALDI Imaging - изучение белков и пептидах непосредственно в тканях... может такую задачу тоже завтра поставят...

Orbi - игрушка конечно интересная, но точно не стартовая...

Я бы выбирал между MALDI-TOF и ESI-QTOF... а по возможности взял бы обе

Но как писал выше - классика протеомики это MALDI, да и освоить его можно намного быстрее и проще в целом...

ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246

Spectrometrist
Пользователь
Ранг: 777

11.08.2011 // 5:59:10

Gl пишет:

Биологическая задача на сегодня определена - идентификация биомаркеров. В том числе секвенирование и ПТМ. Хотелось бы максимум возможностей на перспективу.

Если очень коротко и не очень вежливо, вы или путаетесь в задачах, или хотите несовместимого. Подумайте сами, какие биомаркеры без квантификации? И в то же время вы говорите что кавантификации вроде не надо, а надо " изомеры, конформации". Вам (или вашим сотрудникам) надо учиться протеомной аналитике, виграть travel grant и сьздить в хорошую лабу на пол-года не менее.

Если же деньги надо протратить сейчас или никогда, выбирайте между Q-TOF ами - их много на рынке в разную цену и возможности и новым термовским Q Exactive.

И еще вам, ОБЯЗАТЕЛЬНО нужен хороший 2D LC с нанопотоками, лучше split-free.

Удачи!

Serga
Пользователь
Ранг: 1806

11.08.2011 // 10:01:43

Spectrometrist пишет:
Удачи!

Согласен. Оно им понадобится, как никогда. С нуля начинать такое дело. Я им не завидую...

(PS/ это называется- в начале славных дел...

)

Gl
Пользователь
Ранг: 14

11.08.2011 // 18:40:01

Да, ситуация примерно такая: деньги на прибор можно просить уже сейчас, любые. Задачи точно не ясны, но это биомаркеры и протеомика. В задачах путаемся, как и в технологиях. Гранты на стажировку будут, но потом. Прибор надо выбрать зейчас.
Пока советуют MALDI-TOF, как стандарт в протеомике. Думаем еще над ESI-Q-TOF. LC будем брать, если выберем ESI. Еще точно будем пользоваться капиллярным электрофорезом и возможно, подключим его к ESI (опять же, если не выберем MALDI).
Прямо сейчас есть возможность стажироваться на ESI-Q-TOF, но в лабе нет специалистов по протеомике.

forum_reader
Пользователь
Ранг: 17

11.08.2011 // 19:50:25

Gl пишет:
Прямо сейчас есть возможность стажироваться на ESI-Q-TOF, но в лабе нет специалистов по протеомике.

У вас нет или у коллег с кем работаете? Если у Вас - то Вам все равно надо будет их приглашать со стороны или своих растить, от этого никуда не деться... Выбирите пару протеомных жертв и пусть целенаправленно познают азы у коллег... Если же у коллег есть MS, но нет спецов, тогда это тяжелый случай... Можно еще кого-нибудь порекомендовать из протеомщиков... Вы географически где находитесь?

Каталог ANCHEM.RU
Администрация
Ранг: 246

ВЭЖХ/МС Thermo Fisher Scientific Exactive™
Новый масс-спектрометр высокого разрешения, построенный на базе орбитальной ловушки Orbitrap™. Высокое разрешение, точное определение массы, быстрое сканирование делают этот прибор идеальным как для скрининга компонентов в сложных смесях, так и при исследованиях, требующих предельной точности анализа.

[ Информация из каталога оборудования ANCHEM.RU ]

Gl
Пользователь
Ранг: 14

11.08.2011 // 20:21:19

Новый прибор собираются покупать в Красноярске к весне. Я сейчас в Канаде, здесь есть ESI-Q-TOF на котором можно работать неограниченно, но пока нет серьезных специалистов. Работает меньше года и так же все с нуля. Серьезно до протеомики не добрались (но планируем). К весне собираюсь вернуться в Красноярск на новый прибор. Далее (или прямо сейчас?), видимо, нужны стажировки в действительно протеомной лабе с опытом.

forum_reader
Пользователь
Ранг: 17

11.08.2011 // 23:30:46

А где именно в Канаде? Там есть неплохие протеомные лабы... поспрашиваю у коллег...

Gl
Пользователь
Ранг: 14

12.08.2011 // 0:02:59

Редактировано 2 раз(а)

В Университете Оттавы. От Монреаля 200 км, от Торонто 500. Пока думаем эффективнее всего в Москву съездить поучиться. Но можно и в США поискать. Буду рад услышать советы, к кому лучше съездить.

Islander
VIP Member
Ранг: 1065

12.08.2011 // 2:29:42

Gl пишет:
От Монреаля 200 км.

Вроде, в МакГилле этим серьезно занимаются (и даже две группы), но я в этом не разбираюсь, так что лучше свяжитесь с доктором Нилссоном.

www.mcgill.ca/anatomy/facilities/proteomics

www.gqinnovationcenter.com/services/proteomics/index.aspx?l=e
www.mcgill.ca/symcellbiol/

forum_reader
Пользователь
Ранг: 17

12.08.2011 // 8:41:30

Gl пишет:
Пока думаем эффективнее всего в Москву съездить поучиться. Но можно и в США поискать. Буду рад услышать советы, к кому лучше съездить.

Кстати если в Москву - то один из вариантов Институт Биомедицинской Химии РАМН (ИБМХ)... у них там грамотные спецы... да оборудовани практически всё есть, чтобы посмотреть и попробовать...


Ответов в этой теме: 20 Страница: 1 2 «« назад \|\| далее »»	Ответ на тему

ПОСЛЕДНИЕ НОВОСТИ ANCHEM.RU: [ Все новости ]

Размещение рекламы / Контакты