| Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
 |
|
| ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
 |
Покритикуйте, пожалуйста, нашу бесплатную базу на пол миллиарда конформеров >>>
|
 |
|
SergeyK Пользователь Ранг: 2168 |
 24.12.2020 // 2:27:20
А базы деняк стоят, в свободном доступе не нашел |
|||||
|
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
||||||
|
igorchem Пользователь Ранг: 333 |
24.12.2020 // 2:34:56
Редактировано 1 раз(а) Спасибо большое, SergeyK! |
|||||
|
Lipids Пользователь Ранг: 459 |
24.12.2020 // 5:00:03
"Error in input format" постоянно. |
|||||
|
igorchem Пользователь Ранг: 333 |
24.12.2020 // 5:24:37
Редактировано 1 раз(а) Спасибо за отзыв! Похоже Вы не заполнили ни одного поля, понятно программе было немного сложно понять какие же из 103 миллионов молекул Вы ищите. Разделяю Ваше мнение, что в этом случае надо, чтоб наша программа сообщала что-то другое, но пока в таком случае выдается именно этот тип ошибки. В любом случае, у нас подразумевается, что хотя бы один тип атомов и хотя бы его диапазон будет указан. Но даже Вами далее указанный вариант C10, поэтом в этом случае очень желательно поискать в дополнительном поиске радикалы, которые входят в искомые молекулы, и с помощью таких радикалов существенно ограничить поиск. |
|||||
|
igorchem Пользователь Ранг: 333 |
24.12.2020 // 16:29:30
CAS в Substance файлах оказывается есть, значит скоро в нашей базе эта графа тоже появится 
|
|||||
|
Каталог ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
|||||
|
igorchem Пользователь Ранг: 333 |
26.12.2020 // 16:53:37
Редактировано 1 раз(а) CAS прикрутили, теперь можно искать по PubChem CID и по CAS. Не всегда есть 100% соответствие, так как эту информацию брали из PubChem substances, а там иногда указывают CAS схожих веществ. Планируем на днях закончить объединение всех молекул с различными изотопами в одну структуру, чтобы не было того, что при поиске на кофеин выпадает больше 50 вариантов кофеина с различными изотопным содержанием. |
|||||
|
igorchem Пользователь Ранг: 333 |
16.07.2021 // 9:04:56
Добрый день, подниму эту тему. Базу более-менее сформировали (пока еще без DFT и ab initio), сильно поменяли интерфейс для отображения. Теперь в базе уже 1.7 миллиарда конформеров. Считали сами, сравнивали результаты с молекулярной механикой с открытых источников, совпадение практически полное. База сама как есть будет всегда с нашего сайта доступна бесплатно, надеюсь, всем будет полезна. |
|||||
|
Mukom0l Пользователь Ранг: 16 |
23.07.2021 // 14:34:22
Весьма полезная штука. Было бы неплохо в дальнейшем увидеть не только органику, а помимо ЯМР еще ИК и КР... |
|||||
|
igorchem Пользователь Ранг: 333 |
23.07.2021 // 15:08:18
Редактировано 1 раз(а) Спасибо большое за отзыв! Неорганика, а также элементоорганика вся уже есть. ИК и КР по идее досчитать и добавить тоже можно, но не в самом ближайшем будущем, так как надо будет вначале такое моделирование проверить и только потом в базу вставлять. Кстати, встречный вопрос, скажите, пожалуйста, а есть ли какие-то бесплатные базы по ИК с хорошим покрытием всевозможных типов молекул, на которых можно было бы результаты моделлирования проверить, и, если они получаются адеквытными, то насчиттать на всю нашу базу? |
| |
||
| ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
| Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
|
Размещение рекламы / Контакты |
[]
