| Российский химико-аналитический
портал |
химический анализ и аналитическая химия в фокусе внимания ::: портал химиков-аналитиков ::: выбор профессионалов |
 |
|
| ANCHEM.RU » Форумы » 1. Аналитический форум ... |
 |
софт для МС/МС спектров >>>
|
 |
|
ATem Пользователь Ранг: 655 |
 04.02.2013 // 17:31:39
Как так? О_О Странно... Сейчас еще раз отправлю! Если не придет ничего - либо скажите, сюда сброшу, либо напишите на адрес TemerdashevAZ(собачка)gmail.com |
|||||
|
ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
||||||
|
virtu VIP Member Ранг: 2136 |
05.02.2013 // 1:52:12
Хорошо хоть, что не как в старом анекдоте про мужика, ад и туризм. Да... Такого черного кота в мешке не ожидал увидеть. Всегда так, как только появляется надежда на светлое будущее, вдруг... Ничего, руки дойдут - поиграюсь. Спасибо ATem. |
|||||
|
virtu VIP Member Ранг: 2136 |
05.02.2013 // 1:53:42
Все получил. Большое спасибо. |
|||||
|
ATem Пользователь Ранг: 655 |
05.02.2013 // 17:09:08
Не за что  Если чем-то еще смогу помочь - пишите, с удовольствием  По поводу моего вопроса... Дело в том, что меня всегда радовала возможность наложить большое количество базовых пиков, после чего сделать базовый сдвиг и посмотреть на одной хроматограмме все интересующие меня компоненты. Термо мне такого не позволяет. Т.е. можно наложить разные хроматограммы друг на друга (до 7 штук) или добавить эти самые 7 базовых пиков... Но что делать, если мне надо не 7, а 60? Кому-то может это показаться извращением, но мне действительно удобнее и нагляднее так... А XCalibur предлагает все делать в Процессинге, как я понимаю. Выделять окно для компонента, там хоть 200 штук пусть будет... Но мне перед этим надо же условия оптимизировать, а это намного удобнее делать именно добавлением базовых пиков (хотя, наверное, уместнее сказать ионов) на одну хроматограмму и смотреть, где как менять градиент
|
|||||
|
virtu VIP Member Ранг: 2136 |
06.02.2013 // 1:44:16
Редактировано 1 раз(а) В общем, проприетарный софт (из того, что знаю): MassLynx (Waters), Compass (Bruker), LCMSsolution (Shimadzu). Основное препядствие - форматы файлов данных. Не уверен, что есть пакетная конвертация в ПО, а по одному файлу таскать напряжно... Но, если это не осанавливает, сделайте экспорт нескольких файлов данных Термо в AIA/netCDF и скиньте мне. Свободное ПО - тут надо посмотреть, можно начать с MZmine (ссылка в этой ветке) и Mass++, обе поддерживают формат Термо, но вот насчет того, что Вам нужно - не уверен. |
|||||
|
Каталог ANCHEM.RU Администрация Ранг: 246 |
|
|||||
|
ATem Пользователь Ранг: 655 |
06.02.2013 // 9:52:45
LCMS-Solution у меня есть Попробую повозиться чуток с конвертацией и представленными программами Компасс... Ну, обращусь к коллегам из Брукера, попрошу триал-версию Если очень-очень понравится - задумаюсь о покупке И, наверное, еще посмотрю софт AB Sciex
|
|||||
|
virtu VIP Member Ранг: 2136 |
06.02.2013 // 14:16:04
Редактировано 1 раз(а) Analyst не юзал. Если есть LCMS-solution, тогда пробуйте конвертацию и т.д., может в Xcalibur можно настроить автоматический экспорт данных при сохранении полученной инфы, тогда вообще проблем не будет. Тут главное - возможность автоматизации экспорта данных в Xcalibur, если такой возможности нет, то нужно смотреть на свои возможности по мануальному экспорту данных. Если нужен Compass или Masslynx - пишите. |
|||||
|
ATem Пользователь Ранг: 655 |
06.02.2013 // 18:01:32
Огромное спасибо Вам Надеюсь, с Шимадзянской программой получится скрестить К ней я более привычен
|
|||||
|
ATem Пользователь Ранг: 655 |
09.02.2013 // 11:35:40
Уважаемые коллеги! Благодаря virtu все-таки смог решить свою проблему Делюсь решением, если вдруг кому-нибудь тоже захочется использовать другие программы для пост-обработки данных Автоматический экспорт найти не удалось, зато пройдя следующим путем: XCalibur -> system -> programms находим приложение File Converter. Он позволяет конвертировать raw файлы в форматы ANDI и dat (есть еще третий, но я не помню, к сожалению). Выполняет это достаточно оперативно. А уж ANDI открывается в любой программе для обработки данных Еще раз благодарю virtu за идею
|
|||||
|
Spectrometrist Пользователь Ранг: 777 |
04.03.2013 // 2:06:43
Для полноты картины: был на демо по Mass Frontier. Если очень коротко и без аргументации: если нужно интерпретирвать несколько спектров, то проще делать самому. Классическим путем, ломая мозг над фрагментацией. Огромная датабаза скорее запутывает дело, хотя помогает в мелочах. Опять же, если спектр дерьмовый, то никакой софт здесь не помощник. Но: если надо проскринировать тысячи спектров и отобрать похожие метаболиты, только через софт. Работает очень хорошо и все гораздо серьезнее и эффективнее чем просто разглядывать массы перекрывающихся фрагментов. Я не думаю что софт ну очень поможет людям из фармы, а вот для химии природных соединений похоже незаменимая вещь. Все сугубое ИМХО без претензий на.... |
| |
||
|
Ответов в этой теме: 34
|
||
| ЖУРНАЛ | ЛАБОРАТОРИИ | ЛИТЕРАТУРА | ОБОРУДОВАНИЕ | РАБОТА | КАЛЕНДАРЬ | ФОРУМ |
| Copyright © 2002-2022 «Аналитика-Мир профессионалов» |
|
Размещение рекламы / Контакты |
[]
